灌南县对外贸易经济合作局内设2个职能股室。
一、办公室
负责协助局领导对所属企业的宏观管理、指导和协调工作，负责局机关政务、事务的综合协调工作，承担政策调研、信息处理、对外联络、信访、外事接待、公文、通讯、会务、文书管理、人事调配、劳动工资及行政经费的管理；负责政工、党建、计划生育、纪检监察、社会治安及有关内部行政管理方面的规章制度建设；按照干部管理权限负责系统内干部管理具体工作；负责局机关的机构编制、年度专业技术职称、老干部服务、外经贸干部的境内外培训等工作；负责外销员、国际商务专业技术职务招考工作；负责上报企事业单位出国人员政审工作。
二、综合业务股
拟定促进外经贸发展的政策及建议；拟定外经贸中长期发展规划，编制年度计划，并负责年度目标的考核、检查。研究提出外经贸体制改革实施意见；分析研究国际经贸发展形势，调查、跟踪外经贸整体运行状况、走势和难点、热点问题；负责组织全县对外招商活动，对外贸易行业管理，组织实施外贸中长期发展规划和年度计划；研究并实施货物进出口发展战略和政策措施；承担有关进出口配额计划组织实施工作；负责各类企业进出口经营权的有关管理工作；承担国外反倾销调查方面的有关工作；负责进出口贸易统计和分析；联系国内进出口商会；研究拟定国际服务贸易的政策措施并具体组织实施；管理、协调国际服务贸易工作；组织、指导、协调在境内外举办的外经贸交易会、展销会、洽谈会；贯彻实施国家有关机电产品进出口管理的方针、政策和法规；分析、研究外商投资的情况，定期向县政府报送有关动态；拟定外商投资的发展战略和中长期规划；负责外商投资项目合同、章程及其变更的审批及报批；监督外商投资企业执行有关法律法规和合同情况，跟踪检查和协调服务已批在建外商投资项目；负责外资统计工作；负责外商投诉调解工作；负责起草全县对外经济技术合作的规划、管理措施和办法；执行国家对外经济技术合作的政策、规章；承担对外经济技术合作的管理、协调工作；承担境外承包工程、劳务合作项目的审批、报批工作；参与境外投资项目（不含带料加工装配项目）的建议书和可行性报告的审批、报批工作；会同有关部门承担境外带料加工项目建议书和可行性探究报告的审核、转报工作；具体负责境外投资项目（含带料加工装配项目）的合同、章程的审核、转报工作；负责企业申请对外承包劳务签约权和在国（境）外设立相应机构的审核、转报工作；负责外派劳务业务培训的监督指导工作；负责外经业务统计分析和上报工作；负责拟定和执行开发区管理的措施办法；参与拟定全县开发区发展规划；承担省级开发区的审核、转报；指导、服务、管理、协调、负责指导各类开发园工作。
二、综合业务股
拟定促进外经贸发展的政策及建议；拟定外经贸中长期发展规划，编制年度计划，并负责年度目标的考核、检查。研究提出外经贸体制改革实施意见；分析研究国际经贸发展形势，调查、跟踪外经贸整体运行状况、走势和难点、热点问题；负责组织全县对外招商活动，对外贸易行业管理，组织实施外贸中长期发展规划和年度计划；研究并实施货物进出口发展战略和政策措施；承担有关进出口配额计划组织实施工作；负责各类企业进出口经营权的有关管理工作；承担国外反倾销调查方面的有关工作；负责进出口贸易统计和分析；联系国内进出口商会；研究拟定国际服务贸易的政策措施并具体组织实施；管理、协调国际服务贸易工作；组织、指导、协调在境内外举办的外经贸交易会、展销会、洽谈会；贯彻实施国家有关机电产品进出口管理的方针、政策和法规；分析、研究外商投资的情况，定期向县政府报送有关动态；拟定外商投资的发展战略和中长期规划；负责外商投资项目合同、章程及其变更的审批及报批；监督外商投资企业执行有关法律法规和合同情况，跟踪检查和协调服务已批在建外商投资项目；负责外资统计工作；负责外商投诉调解工作；负责起草全县对外经济技术合作的规划、管理措施和办法；执行国家对外经济技术合作的政策、规章；承担对外经济技术合作的管理、协调工作；承担境外承包工程、劳务合作项目的审批、报批工作；参与境外投资项目（不含带料加工装配项目）的建议书和可行性报告的审批、报批工作；会同有关部门承担境外带料加工项目建议书和可行性探究报告的审核、转报工作；具体负责境外投资项目（含带料加工装配项目）的合同、章程的审核、转报工作；负责企业申请对外承包劳务签约权和在国（境）外设立相应机构的审核、转报工作；负责外派劳务业务培训的监督指导工作；负责外经业务统计分析和上报工作；负责拟定和执行开发区管理的措施办法；参与拟定全县开发区发展规划；承担省级开发区的审核、转报；指导、服务、管理、协调、负责指导各类开发园工作。