县政府办公室
县发展和改革委员会
县经济和信息化局
县教育局
县科学技术局
县公安局
县监察局
县民政局
县司法局
县财政局
县人力资源和社会保障局
县国土资源局
县环境保护局
县住房和城乡建设局
县城市管理局
县交通运输局
县农业委员会
县水利局
县商务局
县文化广电体育局
县卫生局
县人口和计划生育委员会
县审计局
县安全生产监督管理局
县统计局
说明：
灌南县人民政府设置工作部门24个。县监察局与县纪律检查委员会机关合署办公，列入县政府工作部门序列，不计政府机构个数；县政府办公室挂县政府外事与侨务办公室、县政府法制办公室、县人民防空办公室牌子；县发展和改革委员会挂县物价局牌子；县经济和信息化局挂县中小企业局牌子；县科学技术局挂县知识产权局牌子；县财政局挂县政府国有资产监督管理办公室牌子；县住房和城乡建设局挂县规划局牌子；县城市管理局挂县城市管理行政执法局牌子；县农业委员会挂县林业局、县海洋与渔业局、县农业资源开发局、县农业机械管理局牌子；县商务局挂县粮食局牌子；县文化广电体育局挂县旅游局、县文物局牌子；县卫生局挂县食品药品监督管理局牌子。